В 1921 году был образован Емельяновский сельский совет, а в 1936 году, согласно Указу Президиума Верховного Совета РСФСР — Емельяновский район, в состав которого вошли двадцать три сельских совета отошедших от Красноярского района и три от Сухобузимского. В 1983 году из Емельяновского района был выделен Берёзовский район.

На землях Емельяновского района люди селились издревле, начиная с XII—VIII тыс. до н. э., о чем свидетельствуют многочисленные археологические памятники. Наибольшее количество памятников находится на левом берегу Енисея, в долинах рек Кача, Бугач, в окрестностях населенных пунктов Боровое, Дрокино, Куваршино, Частоостровское, Бугач, Емельяново, Солонцы. До прихода русских на землях района обитали отюреченные самодийские племена качинцев, яринцев, ястынцев, бохтинцев, являвшиеся кыштымами енисейских киргизов. С начала XVIII в. они становятся ясачными Качинской и Яринской землиц (c 1822 г. — Качинской степной думы).

После образования Красноярского острога в XVII в. территория района стала активно осваиваться казаками, вольными переселенцами и ссыльными. Первым русским поселением стала деревня Есауловка (1632—1633), немного позже появились деревни Ладейская и Частоостровская (1644). Из-за военной опасности долгое время (вплоть до 30-х гг. XVIII в.) сохраняли военные укрепления, население было вооружено пищалями.

В переписи 1782 г. впервые упоминаются Усть-Батойское, Кожевниково, Куликово, Лопатино, Терентьево, Шумково, Юдино, Горская, Замятино, Кордачино, однодворка на Бугаче, Песчаная, Старцево, Тетерино и Шуваево, Серебряково, Стрешнево, Шилунино, Щелыгино, Солдатово, Суханово, Заледеево, Творогово. В первой половине XIX в. в связи с упорядочением работы Енисейского и Московского трактов, развитием золотопромышленности и расселением 100 казаков с семьями в Красноярском округе появились деревни Перевозная, основанная казаками Торгашинской станицы, Елань, заселенная казаками из Бугачевской станицы, Мало-Кемчугская, Стеклозаводская, основанная в 1839 г.

Население занималось в основном извозом, содержанием постоялых дворов, поставкой продуктов, судостроением, изготовлением саней и телег, производством кирпича, ткачеством. Первым мануфактурным предприятием стала стеклянная фабрика дворянина, красноярского чиновника П. И. Коновалова. На базе местных кварцевых песков изготовлялись разные виды посуды, кувшины и оконное стекло. Крестьяне сеяли в основном пшеницу, пользовавшуюся спросом на городском рынке. Однако большая часть крестьян притрактовых сел занималась не земледелием, а предпринимательством — извозом, торговлей, содержанием постоялых дворов, что объясняется близостью проживания с Красноярском.

В 1839 г. в Красноярск на поселение после отбытия более чем десятилетней каторги был отправлен декабрист М. М. Спиридов — видный член Общества соединенных славян. Еще на каторге он увлекся агрономическими опытами и по приезде в Красноярск обратился с ходатайством о выделении ему земельного участка. Он обработал здесь 40 десятин земли, считавшихся среди местных крестьян бросовыми, используя при этом новую агротехнику. Спиридов начал первым в округе практиковать посадку картофеля. Местные крестьяне, среди которых декабрист активно пропагандировал новую культуру, прозвали ее «спиридовкой». Неутомимая деятельность Спиридова, поначалу воспринимавшаяся крестьянами как «барская причуда», стала вскоре давать свои плоды. Необыкновенно высокие урожаи, которые получал декабрист в своем хозяйстве, убеждали даже скептиков. Помимо земледельческих занятий, Спиридов проявлял живой интерес к промышленным разработкам в крае. Он был тесно связан с местными промышленниками, помогая советами в организации изучения природных ресурсов края.

Развитие товарных отношений ускоряло социальную дифференциацию среди крестьян. Беднота становилась опорой для революционной деятельности большевиков и эсеров в деревне. Особенно восприимчивыми к ней оказались рабочие железнодорожных станций Заледеево, Бугач, Знаменского стеклозавода. На Знаменском заводе весной 1917 г. возникла организация РСДРП, а при активной поддержке рабочих в марте был создан Знаменский совет рабочих депутатов, исполком которого возглавил С. Ф. Кузнецов. В самом поселке с марта по октябрь проходили митинги, демонстрации, на них выступали видные красноярские деятели Я. Боград, Г. С. Вейнбаум, А. Лебедева, Н. Копылов, А. Померанцева. В годы Гражданской войны рабочие Знаменского стекольного завода стали ядром подпольной организации, созданной в ноябре 1918 г. Под руководством Н. Копылова был создан партизанский отряд, в который вошли как рабочие завода, так и крестьяне окрестных сел. Партизаны фактически взяли под контроль железнодорожные пути, нанося своими подрывными действиями ощутимый удар по белогвардейцам.

В январе 1920 г. территория волости была освобождена от колчаковцев, созданы сельские и волостные советы, началось восстановление разрушенного войной хозяйства. В 1924 г. в результате административной реформы Заледеевская и Частоостровская волости вошли в Красноярский район, а в 1936 г. из него был выделен Емельяновский район.

К 1935—1936 гг. в районе уже в основном была завершена коллективизация, создано 59 колхозов и два совхоза, Емельяновская и Частоостровская машинно-тракторные станции. Урожаи хозяйств в районе в довоенные пятилетки выросли до 17 ц с 1 га. В районе получило широкое распространение стахановское движение — гордостью емельяновцев стали передовики М. Орешников, А. Ростовцева, Н. Пурик, Н. Кузьмин.

В годы Великой Отечественной войны более 7 тыс. человек было мобилизовано на фронт, почти половина из них погибли. Звания Героя Советского Союза удостоены В. В. Черняев, И. С. Бородавкин, И. П. Герасимов. После войны в Емельяновском районе началось восстановление сельского хозяйства.

В 1960—80-е гг. в районе построили аэропорт и Красноярский завод тяжелых экскаваторов, крупную птицефабрику. В селах стали активно открываться клубы, строилось жилье и объекты социальной инфраструктуры.

В настоящее время развитие Емельяновского района по-прежнему связано с развитием его ближайшего соседа — города Красноярска. Активно ведется застройка пригородной зоны, растут поселки в зоне часовой доступности от Красноярска.

Районная сеть образовательных учреждений включает 27 средних и основных школ, 16 детских садов, профессиональный лицей, центр диагностики и консультирования и проектно-ресурсный центр, молодежный центр «Галактика». В районе также расположены детские оздоровительные лагеря.

В Емельяновском районе работают 37 сельских домов культуры, 26 библиотек, один межпоселенческий Дом культуры.